南瓜子含丰富的脂肪油(为亚麻仁油酸、油酸等的甘油酯)、蛋白质、胡萝卜素、维生素B1、B2、C，南瓜子氨酸、锌、铁等成分。经常吃南瓜子不但可预防肾结石的发生，还可促进患者排出结石。更重要的是，南瓜子中的活性成分和丰富的锌元素，对前列腺有保健作用。研究发现：每天吃上50克(大概一把)左右的南瓜子，生熟均可，可较有效地防治前列腺疾病。

这是由于前列腺分泌激素功能靠脂肪酸，而南瓜子就富含脂肪酸，可使前列腺保持良好功能。并使前列腺炎，前列腺肥大等疾病的第二期症状恢复到初期，明显改善第三期病情。因南瓜子之中的活性成分可消除前列腺初期的肿胀，同时还有预防前列腺癌的作用。

营养学家还认为，南瓜子中所南瓜子还可用于治疗脾虚营养不良，消瘦乏力;脾虚水肿;产后缺乳;百日咳，咳嗽咽干;南瓜子有很好的杀灭人体内寄生虫(如蛲虫、钩虫等)的作用。 对血吸虫也具有很好的杀灭作用，是血吸虫病的首选食疗之品。南瓜子含有丰富的泛酸，这种物质可以缓解静止性心绞痛，并有降压的作用。经常吃南瓜子不但可预防肾结石的发生，还可促进已有结石的排出。